«رازهای هیساكو» داستان دختر نوجوانی به اسم هیساكوست كه همراه پدربزرگ و مادربزرگش زندگی می‌كند. هیساكو مادرش را از دست داده و فكر می‌كند پدرش هم مرده. او با گرفتن هدیهای مرموز در روز تولدش، به‌دنبال كشف یك راز می‌رود.
دربارهی كتاب هیساكو چگونه می‌تواند از پدرش سخن گوید، درحالی‌‌‌كه در دوسالگی پدرش را از دست داده‌‌‌است. حال كه سیزده‌‌‌ساله شده، معلم سختگیرشان از آنها خواسته تا یك انشای پانصدكلمه‌ای دربارهی ...